Saxogården er en selvejende institution, der indgår i den Selvejende Klynge Saxoly. Daginstitutionen drives som alle andre daginstitutioner og har driftoverenskomst med Københavns Kommune. Derfor er der for forældre, børn og personale ingen synlig eller mærkbar forskel på os og andre daginstitutioner.

Men Klyngen har også en institutionsbestyrelse, der består af medlemmer fra alle afdelinger i Klyngen. Saxoly, Kongerosen og Saxogården.

Institutionsbestyrelsen varetager de overordnede rammer. Det er institutionsbestyrelsens ansvar at sikre, at daginstitutionens og Klyngens administrative og økonomiske opgaver udføres efter gældende regler.